Spółka prowadzi działalność w ramach międzynarodowej grupy kapitałowej, która za pośrednictwem Platformy internetowej, dostarcza swoim klientom rozwiązania w zakresie usprawnienia zarządzania procesami logistycznymi firm. Platforma ta jest swojego rodzaju oprogramowaniem, które dostarcza usługi/produkty klientom. Platforma nie jest własnością Wnioskodawcy, lecz innego podmiotu z grupy kapitałowej, jednakże do Wnioskodawcy należy obowiązek jej rozwoju. Koszty poniesione na rozwój platformy ponosi Wnioskodawca wspólnie z całą grupą kapitałową. Wnioskodawca rozwija platformę poprzez działalność w 4 zespołach programistów. Pierwszy z nich, prowadzi procesy polegające na wzbogaceniu, modyfikacji oraz zmiany kodów źródłowych w obszarze platformy. Drugi zespół, wykonuje testy rozwiązań wprowadzonych przez zespół pierwszy. Trzeci zespół, odpowiedzialny jest za tworzenie i modyfikowanie programów zapewniających komunikację platformy z systemami klientów, natomiast czwarty zespół ma za zadanie wdrażanie klienta na platformę poprzez tworzenie i modyfikacje kodu źródłowego platformy w celu dostosowania jej do wymagań klienta.
Pytanie Spółki dotyczy, czy działania które wypełniają poszczególne zespoły mieszczą się w zakresie działalności badawczo-rozwojowej. Na to pytanie Organ odpowiada negatywnie twierdząc , że pracę wszystkich zespołów, w żadnym razie nie wypełniają ustawowej definicji działalności rozwojowej z uwagi na brak pracy twórczej. Nie można zakwalifikować do prac twórczych działalności polegającej na wprowadzaniu zmian/modyfikacji na potrzeby wymagań klientów w już wcześniej utworzonej platformie. Dodatkowo organ stwierdził ,że „jak wynika z opisu sprawy produkty w postaci ofertowych usług już istnieją a prace inżynieryjno-deweloperskie będące odpowiedzią na bieżące zapotrzebowanie klientów zdaniem tut. Organu są to prace obejmujące zmiany wprowadzane do istniejących usług/produktów. Są to zatem „inne operacje w toku”, które ustawodawca wyłączył z definicji prac rozwojowych. Operacje te, choć mogą prowadzić do ulepszenia istniejących produktów, nie są działalnością polegającą na łączeniu dostępnej wiedzy w celu wytworzenia nowych zmienionych lub ulepszonych produktów ale mieszczą się w pojęciu rutynowych i okresowych zmian dokonywanych w związku z zapotrzebowaniem zgłoszonym przez klienta. Skoro więc, organ stwierdził, że działalność tych zespołów nie jest działalnością rozwojową, spółka nie ma prawa do zaliczanie wydatków poniesionych na te prace jako koszt kwalifikowany.